Στην βιολογία, το περιβάλλον μπορεί να καθοριστεί σαν ενα σύνολο κλιματικών, βιοτικών, κοινωνικών και εδαφικών παραγόντων που δρουν σε έναν οργανισμό και καθορίζουν την ανάπτυξη και την επιβίωση του. Έτσι, περιλαμβάνει οτιδήποτε μπορεί να επηρεάσει άμεσα τον μεταβολισμό ή τη συμπεριφορά των ζωντανών οργανισμών ή ειδών, όπως το φως, ο αέρας, το νερό, το έδαφος και άλλοι παράγοντες. Δείτε επίσης το άρθρο για το φυσικό περιβάλλον και τη φυσική επιλογή.
Στην αρχιτεκτονική, την εργονομία και την ασφάλεια στην εργασία, περιβάλλον είναι το σύνολο των χαρακτηριστικών ενός δωματίου ή κτιρίου που επηρεάζουν την ποιότητα ζωής και την αποδοτικότητα, περιλαμβανομένων των διαστάσεων και της διαρρύθμισης των χώρων διαβίωσης και της επίπλωσης, του φωτισμού, του αερισμού, της θερμοκρασίας, του θορύβου κλπ. Επίσης μπορεί να αναφέρεται στο σύνολο των δομικών κατασκευών. Δείτε επίσης το άρθρο για το δομημένο περιβάλλον.
Στην ψυχολογία, περιβαλλοντισμός είναι η θεωρία ότι το περιβάλλον (με τη γενική και κοινωνική έννοια) παίζει μεγαλύτερο ρόλο από την κληρονομικότητα καθορίζοντας την ανάπτυξη ενός ατόμου. Συγκεκριμένα, το περιβάλλον είναι ένας σημαντικός παράγοντας πολλών ψυχολογικών θεωριών.
Στην τέχνη, το περιβάλλον αποτελεί κινητήριο μοχλό και μούσα εμπνέοντας τους ζωγράφους ή τους ποιητές. Σε όλες τις μορφές της Τέχνης αποτελεί έμπνευση και οι Καλές Τέχνες φανερώνουν την επιρροή οπού άσκησε σε όλους τους καλλιτέχνες με όποιο είδος Τέχνης κι αν ασχολούνται. Ο άνθρωπος μέσα στο περιβάλλον δημιουργεί Μουσική, Ζωγραφική, Ποίηση, Γλυπτική, χορό, τραγούδι, θέατρο, αλλά και όλες οι μορφές τέχνης έχουν άμεση έμπνευση από το περιβάλλον.

Κυριακή 4 Σεπτεμβρίου 2022

WHOLE GENOME SEQUENCING OF SARS‐CoV‐2: COMPARISON OF TARGET CAPTURE AND AMPLICON SINGLE MOLECULAR REAL TIME SEQUENCING PROTOCOLS

alexandrossfakianakis shared this article with you from Inoreader

ABSTRACT

Fast, accurate sequencing methods are needed to identify new variants and genetic mutations of the severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) genome. Single Molecular Real Time (SMRT) Pacific Biosciences (PacBio) provides long, highly accurate sequences by circular consensus reads. This study compares the performance of a target capture SMRT Pacbio protocol for whole genome sequencing (WGS) of SARS-CoV-2 to that of an amplicon Pacbio SMRT sequencing protocol. The median genome coverage was higher (p<0.05) with the target capture protocol (99.3% [IQR: 96.3-99.5]) than with the amplicon protocol (99.3% [IQR :69.9-99.3]). The clades of 65 samples determined with both protocols were 100% concordant. After adjusting for Ct values, S gene coverage was higher with the target capture protocol than with the amplicon protocol. After stratification on Ct values, higher S gene coverage with the target capture protocol was observed only for samples w ith Ct>17 (p<0.01). Pacbio SMRT sequencing protocols appears to be suitable for WGS, genotyping and detecting mutations of SARS-CoV-2.

This article is protected by copyright. All rights reserved.
View on Web
Αναρτήθηκε από στις

Δεν υπάρχουν σχόλια:

Δημοσίευση σχολίου

Εγγραφή σε: Σχόλια ανάρτησης (Atom)